社会科学学部
经济学院
系： 教育部批准设立的研究机构： 国家级示范中心： 国家级虚拟仿真实验教学中心：- 多宝在线经济学科虚拟仿真实验教学中心
- 福建经济研究中心 （省校共建）
- 多宝在线人口研究所
- 多宝在线国民经济与核算研究所
- 多宝在线财政科学研究所
- 多宝在线金融研究所
- 多宝在线社会主义经济制度研究中心
- 多宝在线特区研究所
- 多宝在线公共财政研究中心
- 多宝在线社会经济统计研究中心
- 多宝在线证券研究中心
- 多宝在线澳大利亚研究中心
- 多宝在线WTO研究中心
- 多宝在线评估研究中心
- 多宝在线兴业银行金融创新研究中心
- 多宝在线劳动经济研究中心
- 多宝在线康乃尔合作中心
- 多宝在线中国能源经济研究中心
- 多宝在线世界经济研究中心
- 多宝在线水科技与政策研究中心
王亚南经济研究院
教育部重点实验室： 国家级虚拟仿真实验教学中心： 福建省重点实验室：- 福建省统计科学重点实验室（多宝在线）
- 计量经济学研究中心
- 金融研究中心
- 中国劳动经济学与社会保障研究中心
- 中国宏观经济研究中心
- 政治经济学研究中心
- 现代统计学研究中心
- SAS计量经济学合作中心
- 实验经济金融实验室
管理学院
系（或相当于系的实体机构）：- 会计学系
- 企业管理系
- 管理科学系
- 旅游与酒店管理系
- 财务学系
- 市场学系
- 中国能源政策研究院
- 国家统计局统计科学研究所多宝在线研究基地
- 国家旅游局中国旅游研究院台湾旅游研究基地
- 多宝在线企业发展战略研究中心
- 多宝在线数据挖掘研究中心
- 中国营商环境研究中心
- 多宝在线现代管理科学研究所
- 多宝在线旅游管理与规划研究所
- 多宝在线企业案例研究中心
- 多宝在线中国企业成长研究中心
- 现代企业与医疗服务运营技术管理研究中心
- 多宝在线（正泰数据）资产综合管控研究所
- 多宝在线中国供应链管理研究中心
- 多宝在线管理会计研究中心
- 多宝在线金圆研究院
- 多宝在线中科创业学院
- 多宝在线证券研究中心
- 多宝在线金融工程研究中心
- 多宝在线元创决策智能研究中心
- 多宝在线中国公司金融研究中心
- 多宝在线（元洪）食品数字经济产业研究中心
- 神经管理学与人工智能实验室
- 多宝在线管理学科虚拟仿真实验教学中心
财务管理与会计研究院
法学院
与司法部共建的基地：- 司法部多宝在线现代公共法律服务理论研究与人才培训基地
- 多宝在线福建省地方立法研究与咨询服务基地
- 多宝在线财税金融法治研究中心
- 多宝在线国际经济法研究中心
- 多宝在线立法研究中心
- 多宝在线国家和社会治理法治化研究中心
- 多宝在线党内法规研究中心
- 多宝在线国际经济法研究所
- 多宝在线经济法研究中心
- 多宝在线国际税法与比较税制研究中心
- 多宝在线经济犯罪研究中心
- 多宝在线现代法律服务研究中心
- 多宝在线社会治理与软法研究中心
多宝在线知识产权研究院
厦门国际法高等研究院
公共事务学院
系（或相当于系的实体机构）：- 政治学系
- 公共管理系
- 公共管理教育中心（MPA中心）
- 国家农村社会保险研究中心（劳动与社会保障部委托）
- 妇女/性别研究与培训基地（全国妇联共建）
- 福建女性发展研究中心（省校共建）
- 多宝在线政治学与行政学研究所
- 多宝在线公共管理与政策分析研究中心
- 多宝在线社会发展研究中心
- 公共事务学院教学实验中心
- 多宝在线新西兰研究中心
公共政策研究院
系（或相当于系的实体机构）：- 人口与生态研究所
- 心理学研究所
- 公共政策与地方治理协同创新中心（“省级2011协同创新中心”）
- 多宝在线公共政策与政府治理研究中心（“福建省文科重点研究基地”）
- 多宝在线公共服务质量研究中心 （“福建省社会科学研究基地”）
- 多宝在线区域发展政策研究所
- 多宝在线社会管理创新研究中心
马克思主义学院
福建省批准设立的研究机构：国际关系学院/南洋研究院
系（或相当于系的实体机构）：- 国际关系系
- 侨务与外交系
- 多宝在线东盟研究中心
- 多宝在线马来西亚研究所
- 多宝在线印度尼西亚研究中心
- 多宝在线新加坡研究中心
- 多宝在线“一带一路”与东南亚研究院
- 多宝在线马来西亚研究所
教育研究院
教学部：- 教育学公共教学部
- 教师教育部
台湾研究院
教育部批准设立的研究机构：海峡两岸发展研究院
体育教学部
校批机构：- 多宝在线国术与健身研究中心
继续教育学院
机构：南海研究院
社会与人类学院
系（或相当于系的实体机构）：- 社会学系
- 人类学与民族学系
- 社会工作系
- 人口与生态研究所
- 人类学研究所
- 多宝在线社会发展研究中心
- 旅游人类学研究中心
- 多宝在线文化发展研究院